Herbarium
Belangrijk binnen deze collectie zijn de Haagse vaatplanten, die de botanische verscheidenheid van de stad Den Haag rond het midden van de vorige eeuw laat zien. De kern van dit deel van het herbarium wordt gevormd door de collecties van Marquardt en Mol. Ze hebben als lokale collecties een bijzondere positie binnen de collectie Nederland.
Zaden en houtmonsters
De zaden, vruchten en houtmonsters zijn studiecollecties die in het verleden gebruikt zijn in het land- en tuinbouwonderwijs. De houtmonsters zijn voor een deel afkomstig uit de voormalige koloniën, waar ze als referentiesets voor de bosbouwbedrijven dienden. De zadencollectie wordt breed ingezet, onder andere bij het illustreren van hoe zaden bijdragen aan archeologische analyses en bij de analyses van misdaden.